Сигналка пантера: инструкция по применению и установке, схема подключения, настройка брелока по температуре и времени и видео

не закрывает двери, отвалился пульт

Владельцы автомобилей частенько сталкиваются с ситуацией, когда сигнализация Пантера не реагирует на брелок. Двери приходится открывать ключом, что приводит к срабатыванию сирены и к неприятным впечатлениям. Причины сбоя работы пульта могут быть самыми разными:

• севший элемент питания. Замените на новый;
• машина находится в зоне радиопомех. Припаркуйте автомобиль в другом месте;
• недостаточное напряжение для срабатывания сигнализации. Зарядите аккумуляторную батарею;
• износ противоугонной системы. Обратитесь в сервисный центр;
• рассинхронизация работы брелока и блока управления. Заново пропишите пульт в памяти охранной системы.

Содержание

1. Сигнализация не закрывает двери с брелка
2. Пейджер Pantera SLK 10i неадекватно работает
3. Отвалился брелок SLR 5100: что делать
4. Не заводится машина с пульта Пантера: как исправить
5. Как включить брелок после замены батарейки
6. Как отключить автосигнализацию Pantera без пульта

Узнайте, как привязать брелок Сенмакс.

Сигнализация не закрывает двери с брелка

Противоугонная система Пантера представлена на современном рынке моделями:

• с двухсторонней связью: SPX-1, SLK-468, PR-1, SLR-5625RC, QX-270;
• с односторонней связью: CL-500, SLK-25SC, CL-700, СL-600, XS2500, CL-550, QX-44;
• с функцией автозапуска: SLK-635RS, PR-2, SLK-675RS, SPX-2RS, SLK-650RS, LX-320, SLK-775RS two way, SLK-868RS, SLK-625RS.

Это недорогие и надёжные модели противоугонной системы. Но иногда и у них случаются сбои в работе. Брелок не реагирует на кнопки. Разблокировать автомобиль не удаётся. Рассмотрим наиболее частые причины отказа пейджера сигнализации.

1. Поломка пульта. Почините самостоятельно либо обратитесь к специалистам.
2. Села батарейка в брелке. Вставьте другую.
3. Сел аккумулятор автомобиля – мало напряжения для срабатывания системы. Зарядите аккумулятор или установите новый.
4. «Выпал» пульт. Заново пропишите его в памяти системы.
5. Поломка блока управления. Обратитесь к электрику.

Пейджер Pantera SLK 10i неадекватно работает

В самый неподходящий момент пульт автомобильной сигнализации отказывается работать. Брелок не срабатывает при нажатии кнопок, машину нельзя поставить на охрану и снять с неё. В чём причины?

1. «Отвалился» пульт дистанционного управления. Запрограммируйте его заново в памяти системы.
2. Села батарейка. Смените элемент питания.
3. Автомобиль припаркован в зоне радиопомех. Переставьте его на другое место.
4. Малое напряжение аккумулятора. Подзарядите аккумуляторную батарею или поставьте другую.
5. Выход из строя блока управления сигнализации. Обратитесь к специалистам.

Узнайте как делается привязка брелка Pandora DXL 3000.

Отвалился брелок SLR 5100: что делать

Причин, по которым отказывается работать пейджер несколько.

1. Одна из самых частых – это разряженный элемент питания. Вставьте новую батарейку и проверьте работу пульта.
2. Рассинхронизация брелка. Запишите заново передатчик в памяти охранной системы.
3. Воздействие внешних радиопомех. Поставьте машину в другом месте.
4. Износ противоугоного комплекса. Обратитесь в гарантийный центр.
5. Низкое напряжение аккумуляторной батареи. Зарядите её или же установите новую.

Не заводится машина с пульта Пантера: как исправить

За всё время эксплуатации сигнализации Pantera однажды вы столкнулись с такой проблемой, как перестал работать автозапуск. Незапускаться двигатель автомобиля может по трём причинам:

• нет контроля работающего мотора – проблемы с программированием, подключением или со штатной проводкой;
• проблема с проводами на ручной тормоз;
• малый заряд аккумулятора.

Дистанционный пуск и остановка двигателя производится по следующему алгоритму.

1. Затяните ручной тормоз, автоматическую коробку установите в режим “PARK”.
2. Выставите настройки кондиционера.
3. Вентиляцию поставьте в режим рециркуляции.
4. Два раза нажмите на клавишу с символом звёздочки. Одиножды моргнут поворотники. Двигатель запустится.
5. Для остановки мотора нажмите на кнопку с символом звёздочки. Последует сигнал сирены и 2-ух секундный вибросигнал.

Что делать, если брелок Пандора не видит машину.

Как включить брелок после замены батарейки

Смена батареи производится каждые три-четыре месяца и зависит от частоты использования пульта. Поменять элемент питания вы можете самостоятельно, следуя инструкции.

1. Снизу подденьте крышку батарейного отсека.
2. Сдвинув, снимите крышку.
3. Выньте севшую батарею.
4. Вставьте новую батарею (тип ААА). Соблюдайте полярность.
5. Установите всё на своё место.

После этого зажмите одновременно две клавиши: «Открытый замок» и «Снежинка». Брелок должен самостоятельно восстановить код связи с блоком управления.

Как отключить автосигнализацию Pantera без пульта

Если вы потеряли пейджер или у него сели батарейки, то откройте машину ключом. Не обращайте внимания на то, что сигнализация орёт, моргают осветительные огни, горит свет в салоне. Охранная система сработала в штатном режиме, и вы можете её отключить даже в активной фазе.

1. Вставьте ключ в замок зажигания. Включите, выключите и сразу же включите зажигание.
2. Нажмите на 10-15 секунд на клавишу «Валет».

Режим тревоги отключится, с двигателя снимется блокировка.

Узнайте, как прописать брелок Пандора.

Сигнализация пантера с автозапуском: инструкция по эксплуатации

На чтение 6 мин. Просмотров 35.7k. Опубликовано 25.10.2019 Обновлено 13.10.2020

Автомобильные сигнализации PANTERA давно завоевали уважение. Надежное шифрование и дизайн позволяет ей прочно удерживать внимание к своей системе безопасности. Особенно востребованы модели сигнализации с автозапуском и двухсторонней связью. Эти системы имеют настолько широкую гамму функций, что без инструкции пользователя трудно во всем разобраться.

Модели с автозапуском

Сейчас можно приобрести современные системы автосигнализаций с функцией автозапуска:

1. SLK-775RS;
2. SLK-868RS;
3. SPX-2RS;
4. PR-2.

Эти модели обладают целым пакетом добавленных опций и считаются самыми надежными в части шифрования сигнала и считывания кодов.

Возможности и режимы моделей

Сигнализация SLK-775RS – это наиболее упрощенный вариант. Ее нельзя подключить к CAN-шине автомобиля.

В набор ее функций входят:

• двусторонняя связь;
• автозапуск двигателя;
• турботаймер;
• защита от перехвата сигнала;
• недопущение сканирования;
• отключение системы сигнализации в два этапа.

А вот модель SLK-868RS – вариант адаптирован к любым типам коробок передач. Она имеет функцию интеграции контроля работы мотора по оборотам и давлению масла. Для охраны кода от попыток считать его, в ней используется метод динамического шифрования канала и удвоенную частоту, что доводит диапазон действия до 2 км и существенно снижает помехи.

SPX-2RS охраняет от взлома и код-граббинга за счет одновременно работающих двух диалоговых и дублирующих каналов связи.

К другим функциям можно отнести:

• перепрограммирование добавочных каналов;
• подключение к CAN шине и иммобилайзеру;
• 7 зон охраны;
• двухсторонняя связь;
• режим «Паника»;
• функция вызова водителя;
• управление через GPS и GSM;
• двухэтапное отключение охраны.

Модель PR-2 – наиболее современная версия. За счет использования современных диалоговых каналов связи она делает недопустимым взлом код-грабберами.

К ее специфике относят:

• скорый отклик на нажатие;
• самостоятельные зоны охраны;
• расстояние работы до 1, 2 км.

Как пользоваться брелоком

После установки системы автосигнализации пантера следует настроить сам брелок, он же – пульт управления. В первую очередь выполняется программирование брелока в пульте управления.

Обозначение значков

В комплекте системы автосигнализации пантера входят два вида брелоков: с пятью кнопками и ЖК-дисплеем, а также запасной – с четырьмя кнопками. Обозначение значков на кнопках у всех моделей одинаковое.

На жидкокристаллическом дисплее значки обозначают следующие функции

Как узнать модель по брелоку

Когда неизвестно, какая модель сигнализации установлена, нужно действовать по алгоритму:

1. Внимательно осмотреть брелок, обращая внимание на любые надписи, которые могут рассказать о системе или марке.
2. Если ничего не нашлось, следует разобрать корпус и осмотреть плату и чип на наличие надписей. Через интернет можно определить, на какие системы могли быть установлены такие элементы.
3. Определить по фотографиям похожие брелоки по: внешнему виду, количеству и расположению управляющих кнопок.
4. При нахождении похожего брелока следует прочитать инструкцию по пользованию и сравнить возможности со своей системой.

Как завести машину с брелока

Все указанные системы автосигнализации с двухсторонней связью дают возможность владельцу автомобиля запустить, и заглушить двигатель дистанционно. Для этого следует дважды нажать на кнопку с символом ✱ с паузой не более трех секунд.

При этом квитирование происходит через краткое включение поворотных огней. При неудачном запуске повторить эту процедуру можно трижды. Системы кондиционирования и вентиляции включаются через 1,5 минуты, если не были настроены на другой режим.

Продолжительность работы двигателя составляет 12 минут, если не были установлены другие параметры.

Выключение двигателя производится однократным нажатием на кнопку ✱. Сработка подтверждается акустическим или вибросигналом.

Инструкция по брелокам

Для правильной работы системы важно правильно настроить брелоки. Это осуществляется с помощью прилагаемой к самой системе инструкции. Она состоит из нескольких разделов. В первом разделе перечислены все функции системы автосигнализации. Во втором – настройка тех или иных команд. В следующем – о работе светодиодного датчика и специальной кнопки “Valet”. Во второй части расписаны настройки каждой из функций и последовательность настраивания.

Как привязать брелок к машине

В память автосигнализации pantera можно вписать по два брелока с пятью и четырьмя кнопками. Для это следует соблюдать алгоритм действий:

1. Активировать зажигание.
2. На шесть секунд нажать сервисную кнопку “F”. Дождаться ответного четырехкратного ЧИРПа.
3. Одновременно надавить и держать кнопки “Открыть багажник” и “AUX” до однократного сигнала сирены.
4. Выключить систему зажигания.

Для развернутых разъяснений следует обратиться к инструкции на каждую из моделей.

Инструкции к сигнализации “Пантера”

Подробные инструкции на установку автосигнализаций пантера дадут возможность разобраться во всех тонкостях ее эксплуатации. Загрузить сервисные инструкции по настройке и управлению автосигнализациями pantera можно по ссылкам.

Модель SLK-775RS

Модель SLK-868RS

Модель SPX-2RS

Модель PR-2

Схема подключения сигнализации “Пантера”

Поскольку автосигнализации пантера относятся к сложным электронным системам, то проводят ее установку только квалифицированные специалисты, так как требуется подключение к штатным системам автомобиля.

Схема для модели SLK-775RS

Скачать схему и инструкцию для подключения:

Инструкция по установке: Pantera SLK-775RS installer

Схема для модели SLK-868RS

Скачать схему и инструкцию для подключения:

Инструкция по установке: Pantera SLK-868RS installer

Схема для модели SPX-2RS

Скачать схему и инструкцию для подключения:

Инструкция по установке: Pantera SPX-2RS installer

Схема для модели PR-2

Скачать схему и инструкцию для подключения:

Как отключить сигнализацию пантера

Есть ситуации, когда нужно снять сигнализацию пантера. В таких случаях ее можно отключить несколькими способами:

• при помощи брелока;
• обесточиванием ;
• с помощью секретной кнопки Valet.

Последний способ иногда нужен для аварийного запуска двигателя. Тогда нужно провести несколько нажатий на кнопку и несколько раз включить-выключить зажигание. Все это нужно проделать в определенной последовательности.

как узнать модель по брелку и не только

Сигнализация Пантера — как узнать модель по брелку? Посмотрите на надписи на устройстве или определите тип охранной системы по количеству кнопок и внешнему виду. Для этих целей можно использовать официальный сайт производителя или продавцов подобного оборудования. Ниже рассмотрим, как определить тип охранной системы, рассмотрим наиболее популярные варианты и их особенности.

Как узнать модель сигнализации Пантеры

Один из способов получить нужную информацию по автосигнализации Пантера — узнать модель по брелку. Но предварительно пройдите следующие шаги:

• Посмотрите в документы по охранной системе, которые шли в комплекте. В них должны быть интересующие сведения по автосигнализации.

• Осмотрите пульт. На некоторых устройствах тип сигнализации Pantera можно узнать модель по брелку. Как вариант, можно разобрать устройство и посмотреть надписи внутри.
• Попробуйте определить тип девайса по внешнему виду и функциональным особенностям. Для этого пригодится рассмотренная ниже информация.

Наиболее распространенными являются охранные системы Пантера с односторонней и двусторонней связью. С учетом этого можно делать выводы.

Для устройств с односторонней связью:

1. 5 клавиш — SLK-635RS, CL-700, SLK-675RS, QX-270, SLK-468, SLR-5625RC, SLK-625RS;
2. 4 кнопки — SLK-635RS, CL-700, SLK-675RS, QX-270, SLK-468, SLR-5625RC, SLK-625RS;
3. 3 клавиши — CL-500, СL-600, QX-44, CL-550;
4. 2 кнопки — XS-100, SLK-20SC, XS-200, CLK-350, SLK-15.

Иногда возникает вопрос, как узнать модель по брелку для сигнализации Pantera для девайсов с двусторонней связью. Они представлены двумя моделями — SPX-1 и PR-1. Если у вас предусмотрено дополнительно опция автозапуска, охранная система имеет следующие отметки — SPX-2RS, PR-2, SLK-868RS, SLK-775RS. Первые два брелка Пантера легко распознать по оранжевой боковой части, а в последних двух сбоку доступно четыре обычных кнопки.

Подробную информацию можно найти на сайте pantera.ru. Здесь представлены данные по действующему модельному ряду, функциональным возможностям и другим особенностям охранных систем с фотографиями.

Альтернативные варианты

Выше мы рассмотрели основные пути, как в сигнализации Пантера определить модель по брелку, и можно ли это сделать. Если узнать нужную информацию по какой-то причине не удалось, попробуйте следующие варианты:

• Воспользуйтесь программой Google Lens (Объектив), доступной по ссылке play.google.com/store/apps/details?id=com.google.ar.lens&hl=uk&gl=US. Установите ее на телефон с Андроид, наведите объектив камеры на пульт и жмите на поиск. Система помогает узнать модель сигнализации Пантера по брелку. В частности, появляются ссылки на товар, по которым легко получить нужную информацию.

• Обратитесь к специалистам. Еще один путь — приехать на СТО к мастерам, которые занимаются подобными вопросами (монтаж, ремонт охранных системы). С их помощью можно быстро узнать по брелку, какая сигнализация Пантера стоит на вашей машине. Этот вариант подходит для тех пользователей, которые не ходят разбираться в модельном ряде и искать информацию о Пандора в Интернете.
• Позвоните в техническую поддержку производителей оборудования. Для этого наберите 8-800-33-303-23 и задайте интересующий вопрос.

Почему важно знать свою модель

Выше мы рассмотрели основные пути, как узнать модель сигнализации Пантера по брелку или иными способами. Такие знания могут пригодиться, когда необходимо заменить пульт управления охранным оборудованием, выполнить его настройку, отключить сигналку или разобраться с комплектацией и надписями на дисплее (с тем же Disarm например). Кроме того, точно название может потребоваться при программировании и отключении сигнализации Пантера в случае сбоев в работе.

В комментариях поделитесь, какие методы еще позволяют узнать тип охранной системы по пульту управления или иными способами.

Обзор характеристик сигнализации на авто Пантера (Pantera), инструкция

Покупая сигнализацию, любой автовладелец хочет выбрать такую противоугонную систему, которая будет наиболее надежной. Поскольку ассортимент таких систем на рынке сегодня очень большой, иногда сделать правильный выбор бывает сложно. В этой статья мы рассмотрим основные характеристики, которыми обладает сигнализация Pantera, рассмотрим процесс подключения и настройки, а также расскажем о возможных неисправностях.

Содержание

[ Раскрыть]

[ Скрыть]

Особенности

Автомобильная сигнализация Pantera имеет некоторые особенности, предлагаем вам узнать о них:

• система может работать в широком диапазоне температур;
• в продаже есть множество моделей, поэтому водитель всегда может сделать выбор, ориентируясь на свои предпочтения и финансовые возможности;
• отличное соотношение стоимости и функционала, даже сравнительно недорогие модели имеют множество полезных функций;
• большинство моделей автомобильной сигнализации имеют функцию удаленного открытия или закрытия дверей авто;
• также большинство моделей оснащено опцией автозапуска;
• по утверждению производителя, любая автомобильная сигнализация Pantera имеет надежный цифровой канал передачи данных, в результате чего возможность ее взлома сводится к минимуму.

Виды и модели

Комплект сигнализации Pantera

Рассмотрим наиболее популярные модели автомобильных сигнализаций, которые сегодня можно найти в продаже. Фото таких устройств вы найдете в статье.

1. Pantera SLK 625RS с двумя брелоками представляет собой одну из самых популярных среди наших автолюбителей противоугонных системы. Модель SLK 625RS оборудована опцией автозапуска мотора. Согласно данным в инструкции по эксплуатации, дальность работы составляет 1 км, если активирован режим оповещения, то дальность может составить и 2 км. Разумеется, по факту этот показатель будет ниже, поскольку такая дальность актуальна для открытой местности, без строительных сооружения.
2. SLK 675RS ver.2. Также наши автолюбители часто выбирают модель SLK 675RS ver.2. Устройство SLK 675RS ver.2 также оснащено функцией автозапуска, благодаря которой автомобилист всегда может установить определенное время, в которое двигатель должен завестись.
3. Модели автомобильной сигнализации с двумя брелоками Pantera SLK 20SC, SLK 35SC обладают достаточно широким функционалом. Из инструкции по эксплуатации вы можете узнать, что SLK 35SC оборудована функцией дистанционного открытия дверей и багажника. Одной из особенностей SLK 35SC является опция «вежливого» освещения, для подключения которой потребуется дополнительное реле.
4. Модели Pantera XS-1500 и XS-1000 с двумя брелоками оборудованы опциями защиты от ложных включений. Также в устройствах Pantera XS-1500 и XS-1000 имеется режим «Паника», который был усовершенствован инженерами компании-производителя. Pantera XS-1500 и XS-1000 позволяют автоматически поставить автомобиль на охрану, также эти системы оснащены иммобилайзером. При необходимости Pantera XS-1500 и XS-1000 позволяют настроить систему так, чтобы двери автоматически закрывались после включения зажигания.
5. Pantera QX 270. Одной из отличительных особенностей Pantera QX 270 с двумя брелоками является возможность программирования персонального кода, который позволит отключить систему. Если автомобиль QX 270 попадает в потенциально опасную зону, к примеру, с электромагнитными волнами, то на брелке высветится соответствующее сообщение. Кроме того, там же, на брелке QX 270 будет указана ближайшая безопасная зона для того, чтобы оставить авто.
6. QX 44. Что касается модели QX 44, то у нее также есть некоторые особенности. К примеру, как сказано в инструкции по эксплуатации, система 44 оснащается громкой и очень мощной шеститональной сиреной и шестью независимыми зонами охраны в машине.

Инструкция по применению

Если вы решили приобрести сигнализацию этого бренда с двумя брелоками, то вам полезно будет ознакомиться с инструкцией по эксплуатации. Какова схема подключения, как правильно настроить и отключить? Ответы на эти вопросы вы найдете ниже.

Как подключить?

Чтобы правильно подключить противоугонную систему к транспортному средству, воспользуйтесь схемой подключения, приведенной ниже. Схема приведена в соответствии с инструкцией по эксплуатации.

Схема подключения автомобильной сигнализации Pantera

Как настроить?

Чтобы правильно подключить и настроить систему, воспользуйтесь инструкцией по эксплуатации. Как вы понимаете, видов таких автосигнализаций достаточно много, соответственно, инструкций по настройке и эксплуатации будет для всех видов разной. Чтобы касается общих настроек, то необходимо отметить один момент. В том случае, если система срабатывает даже при простом движении рядом с транспортным средством, необходимо выполнить перенастройку функции чувствительности.

В большинстве случаев, как указывается в инструкции по эксплуатации, причин повышенной чувствительности может быть две:

• если уровень чувствительности системы выставлен на самом высоком уровне;
• если датчик удара установлен некорректно или плохо закреплен.

Чтобы снизить уровень чувствительности противоугонной системы, необходимо воспользоваться инструкцией по эксплуатации. Как сказано в сервисном мануале, необходимо произвести настройку регулятора, установленного непосредственно на датчике удара.

Специалисты рекомендуют выставлять пятый уровень по шкале, но здесь обычно все индивидуально. Вам необходимо выставить тот или иной уровень, после чего легонько постучать по лобовому стеклу или кузову транспортного средства. Так вы сможете подобрать нужный уровень. Чтобы включить или отключить сигналку, просто воспользуйтесь соответствующими кнопками на брелоке (автор видео — Auto Azart).

Возможные неисправности

Как показывает практика, в общем автомобильная сигналка Pantera — это надежная противоугонная система.

Но как показывают отзывы, есть определенные неисправности, характерны для таких сигнализаций:

1. Пульт отказывается работать. В этом случае вариантов решения проблемы может быть несколько. В первую очередь необходимо произвести проверку работоспособности батарейки в брелке, как показывает практика, чаще всего проблема заключается именно в ней. При регулярной эксплуатации низкокачественных батареек есть вероятность того, что из них начнет выделяться едкая жидкость, которая может нанести вред в случае попадания на плату. Если замена батарейки не помогает, то можно попробовать произвести синхронизацию брелока с противоугонной системой в соответствии с инструкцией.
2. Поломка самого блока системы. Сам блок системы обычно ломается редко, но несмотря на это с проблемой выхода из строя также сталкиваются некоторые автовладельцы. Как правило, блок может выйти из строя при попадании на него влаги, часто это случается в отечественных автомобилях, в которые попадает вода во время дождя. Если блок установлен под тросом капота в салоне, то учтите, что при попытке открыть капот вода может попадать в салон именно по тросику. А если устройство установлено прямо под ним, то вероятность того, что рано или поздно блок замкнет, очень велика.
3. Перегорание светового индикатора. При долгой эксплуатации сигналки есть вероятность, что со временем перегорит световой индикатор. На работе противоугонной системы это никак не отразится, но водитель не сможет узнать, поставил ли он авто на сигналку или нет. Проблема решается путем вскрытия индикатора и замены лампочки на новую.

Плюсы и минусы противоугонной системы

Сначала преимущества:

• автомобиль всегда будет под надежной охраной;
• при необходимости сигналку можно настроить так, чтобы она была наиболее чувствительной и реагировала даже на прикосновения к авто;
• нормально функционирует даже при критически низких температурах;
• функция автозапуска позволит садиться за руль уже прогретого авто в сильный холод.

Недостатки:

• цена не всегда соответствует качеству;
• при отсутствии опыта выполнить монтаж противоугонной системы самому может быть проблематично;
• на практике пульты выходят из строя часто;
• цены на качественные варианты Pantera довольно высоки.

Видео «Как синхронизировать пульт с сигналкой»

Подробнее об этом узнайте ниже (автор видео — В гараже).

 Загрузка …

Архив: Автосигнализация Pantera CLK-355 — Угона.нет

Бюджетная автомобильная сигнализация. В комплекте: два 4-кнопочных программируемых брелка-передатчика с динамическим кодом Keeloq, 2-уровневый датчик удара, и мощная 6-тональная сирена. Имеются функции  «Anti-Carjacking» с возможностью активного безопасного глушения двигателя и блокировки стартера встроенным реле. Также имеется возможность подключения до 2-х дополнительных блокировок двигателя.

Обновление модельного ряда автосигнализаций Pantera повлекло за собой и выход новой модели CLK-355. Данная автомобильная сигнализация разработана специально для эксплуатации в российских условиях и предназначена по большей части для массовой установки на отечественные автомобили (поэтому, и цена соответствующая). Однако, тем не менее, в соответствии с назначением системе внедрили широкий набор программных функций вариаций подключения, которые бы позволяли ей полноценно функционировать на автомобилях разных классов и марок. Система использует внешнюю блокировку и 40-амперное реле с готовой колодкой в комплекте.

В полной комплектации оснащается мощной 6-тональной сиреной, 2-уровневым датчиком удара, СИД, документми, кнопкой-переключателем Valet. Режим Valet, кстати, может активироваться/деактивироваться дистанционно — с брелка, причем с предупредительными сигналами. Брелки-передатчики просты, и в то же время многофункциональны. 4 кнопки обеспечивают управление системой. Режим охраны активируется/деактивируется разными кнопками. Большой плюс – это то, что брелки не перегружены разными функциями, но зато имеют весьма слабую дальность действия — всего до 40 м.

Набор охранных возможностей, помимо стандартного набора, имеет режим иммобилайзера, возможность охраны при заведенном двигателе, активацию режима охраны без использования передатчика, 2-этапное снятие с охраны, активация режима охраны с раздельным отключением зон датчика удара. Предусмотрено и дистанционное включение бесшумной охраны. Этот режим подкреплен возможностью подключения пейджера к одному из программируемых выходов.

Система оснащена одним программируемым каналом. Автосигнализация Pantera CLK-355 – пакет по минимальной цене с максимальным набором функций, не уступающим по уровню охраны и сервиса другим более дорогим системам.

Технические характеристики:

• 4-кнопочный программируемый брелок-передатчик без ЖК-дисплея (2 шт.)
• Динамический код Keeloq™
• Противоугонная функция ‘Anti-Carjacking’
• Возможность активного безопасного глушения двигателя
• 2-уровневый датчик удара
• 6-тональная сирена
• Возможность блокировки стартера встроенным реле
• Возможность подключения до 2-х дополнительных блокировок двигателя
• Возможность управления замками дверей
• Присутствие функции раздельного управления правыми/левыми указателями поворота при помощи встроенного реле
• PIN-код отключения системы с возможностью программирования
• Охрана авто при заведенном двигателе

Наличие выходов:

• Силовой выход 2-го канала для отпирания багажника/подключения дополнительных устройств
• Выход для управления «вежливой подсветкой» / модулем стеклоподъемников / дополнительным пейджером

Инструкция по эксплуатации сигнализации Pantera (Пантера): схема подключения и настройка

Автор: Виктор

В наше неспокойное время защита транспортного средства стало актуальной проблемой. Естественно, на рынке появился большой выбор охранных систем. В статье рассматривается сигнализация Pantera: ее особенности, достоинства и недостатки, модели, инструкция по эксплуатации.

Содержание

Открытьполное содержание

[ Скрыть]

Характеристика противоугонной системы

Автосигнализация Pantera — противоугонная система нового поколения.

Модельный ряд

Сигнализации Pantera представлены в широком ассортименте. Определить модель можно по брелоку, а также узнать об их возможностях можно из руководства по эксплуатации.

SLK 625RS

Охранная система SLK 625RS приобрела большую популярность. Модель с автозапуском и двусторонней связью. В комплект входит два брелока управления.

Сигналка SLK 625RS

SLK 675RS ver 2

Сигнализация Pantera SLK 675RS ver 2 имеет стандартный набор функций, как и в предыдущей версии, но дополнена функцией автоматического запуска двигателя в заданное время. Двухуровневый датчик удара позволяет настроить правильно чувствительность, исключив, таким образом, ложные срабатывания.

QX 270

Данная автосигнализация с двумя брелоками имеет возможность программируемого кода, позволяющего отключать систему. Есть возможность включения режима тревоги и его отключения в два этапа. В комплекте с QX 270 инструкция содержит информацию по установке и настройке (автор видео — Avtozvuk.ua — База Автозвука).

XS 1000

Модель XS 1000 оснащена двумя передатчиками, динамичным кодом защиты, двухуровневым датчиком удара. Идущая в комплекте с системой XS 1000 инструкция дает возможность разобраться с установкой и настройкой. Бесшумная постановка в режим охраны и снятие с него, защита от ложных срабатываний – плюсы XS 1000.

Плюсы и минусы девайсов

Автомобильная сигнализация Pantera завоевала свою популярность преимуществами, которыми обладает:

• бесшумное включение и отключение режима охраны;
• защитный динамичный код;
• автозапуск двигателя с возможностью прогрева салона;
• стабильная работа в широком диапазоне температур;
• программируемые функции;
• брелоки с двусторонней связью.

Наряду с достоинствами есть недостатки:

• монтаж требует специальных знаний;
• иногда стоимость не отвечает качеству;
• при хорошем качестве высокая цена;
• выходят из строя не раньше заявленного гарантийного срока.

Руководство по эксплуатации и установке

Перед установкой автосигнализации своим руками следует изучить инструкцию по установке и настройке, которая есть у всех руководств по эксплуатации.

Схема подключения компонентов

Установка состоит из этапов:

1. Сначала следует отключить питание авто, сняв клемму с минусом на АКБ.
2. Под капотом размещается сирена рупором вниз.
3. В салоне устанавливается блок управления.
4. Далее необходимо установить датчик удара, концевики багажника и капота, сервисную кнопку Valet.
5. Далее нужно выполнить подсоединение к бортовой сети.

Настройки для каждого вида сигнализации имеют свои нюансы. Поэтому по поводу настроек для конкретной модели лучше обратиться к руководству по эксплуатации.

После установки нужно проверить работоспособность охранной системы, чтобы уверенно пользоваться.

Как отключить устройство?

Отключение автосигнализации выполняется путем нажатия кнопки на брелоке. Если этого не произошло, то нужно знать, как отключить сигнализацию.

Следует поступить следующим образом:

• уменьшить расстояние, причиной могут быть радиопомехи;
• проверить зарядку АКБ автомобиля;
• заменить батарейки в брелоке;
• если вы забыли пин-код, то узнавать его нужно у фирмы, устанавливающей систему;
• следует проверить предохранители.

Если перечисленные меры не дали результата, следует обратиться на фирму, которая занималась установкой.

Фотогалерея

1. Модель SLK 400 SC

2. Охранная система 675RS ver 2

3. Комплект Pantera-XS 1500

Цена вопроса

Плюсом охранных систем Pantera является возможность выбора модели по своим финансовым возможностям. Правда, низкая цена порой означает и низкое качество. Это стоит учитывать, выбирая сигналку для своего автомобиля.

 Загрузка …

Видео «Установка сигнализации Pantera»

На этом видео показан процесс установки Pantera CL 500 (автор ролика — Сделай Сам).

Отзывы об автосигнализациях Pantera: Оценки, Рейтинги, Сайт, Страна

Что мы знаем о автосигнализациях Pantera

Бренд производителя зарегистрирован в стране — Россия. Официальный сайт находится по адресу: http://pantera.ru/.

В августе 2021 на PartReview сложилось неоднозначное мнение о автосигнализациях Pantera.

Оценка PR — 68 из 100, базируется на основе 22 отзывов и 73 голосов. 12 отзывов имеют положительную оценку, 7 — нейтральную, и 3 — отрицательную. Средняя оценка отзывов — 3.8 (из 5). Голоса распределились так: 50 — за, 23 — против.

В рейтинге лучших производителей автосигнализаций запчасть занимает 6 позицию, уступая таким производителям как Starline и SCHER-KHAN , но опережая автосигнализации SHERIFF и KGB.

Пользователи также составили мнение о качествах автосигнализаций Pantera:

1. Функционал — разнообразие дополнительных функций — оценивается позитивно. 5 баллов из 5.
2. Ошибки в работе — склонность выдавать ложные срабатывания и ошибочные показатели — оценивается негативно. 2 балла из 5.
3. Установка — удобство установки оборудования — пока нет оценки

Автосигнализация Pantera в авторейтингах

Здесь можно узнать владельцы каких марок и моделей ставили автосигнализации Pantera на свои авто. Далее список авторейтингов, в которых данная запчасть входит в ТОП-3 лучших:

1. Pantera на первом месте в авторейтинге автосигнализаций для: ВАЗ (Lada) Priora .
2. Pantera на втором месте в авторейтинге автосигнализаций для: Toyota Mark 2, ВАЗ (Lada) 21099, Hyundai Sonata, Volkswagen Passat .
3. Pantera на третьем месте в авторейтинге автосигнализаций для: Volkswagen Touareg .

Автосигнализация Pantera в сравнении

На PartReview доступны 8 сравнений автосигнализаций Pantera c другими производителями.

В частности можно выяснить, чьи автосигнализации лучше: Pantera или KGB, Pantera или CONVOY, Pantera или PANDECT, SCHER-KHAN или Pantera, Pantera или Pandora .

ПАНТЕРА — Путь

Путь PANTHER состоит из более 177, в первую очередь сигнальных, путей, в каждом из них есть подсемейства и белковые последовательности, сопоставленные с отдельными компонентами пути.Компонент обычно представляет собой отдельный белок в данном организме, но несколько белков иногда могут играть одну и ту же роль. Пути вычерчиваются с помощью программного обеспечения CellDesigner, фиксируя события на молекулярном уровне как в сигнальных, так и в метаболических путях, и может быть экспортирован в формат SBML. Вид диаграммы SBGN также можно экспортировать. Диаграммы путей являются интерактивными и включают инструменты для визуализации данных экспрессии генов в контексте диаграмм. Календарь выпуска Pathway Просмотрите полный список из более чем 177 путей PANTHER, компонентов путей и просмотрите диаграммы. Поиск путей и их компонентов по ключевым словам, таким как молекулярная функция, биологический процесс, взаимосвязи и взаимодействия путей или семейства PANTHER. См. Список полезных ресурсов, включая ссылки на другие наборы данных о путях и инструменты для редактирования и просмотра биологических моделей. См. Полный список рекомендованных путей.

база данных путей на основе онтологий, соединенная с данными средства анализа

Методы Mol Biol. Авторская рукопись; доступно в PMC 3 июля 2019 г.

Опубликован в окончательной отредактированной форме как:

PMCID: PMC6608593

NIHMSID: NIHMS1011857 ​​

Evolutionary Systems Biology Group, SRI International, 333 Ravenswood Avenue, Menlo Park, CA 94025

Окончательная отредактированная версия этой статьи издателя доступна на сайте Methods Mol Biol. См. Другие статьи в PMC, в которых цитируется опубликованная статья.

Abstract

Доступность полных геномных последовательностей различных модельных организмов и увеличение экспериментальных данных и литературы стимулировали эволюцию системный подход к биологическим исследованиям. Развитие вычислительных средств и алгоритмы для изучения сетей биологических путей достигли большого прогресса в помогая анализировать данные исследований. Базы данных Pathway становятся неотъемлемой частью таких подход. В этой главе сначала обсуждается, как биологические знания представлены, в частности, важность онтологий или стандартов в системах биологические исследования.Далее мы используем Путь ПАНТЕРА в качестве примера, чтобы проиллюстрировать, как онтологии и стандарты играют роль в моделировании данных, вводе данных и данных отображать. Наконец, мы описываем использование таких систем. Мы также описываем вычислительные инструменты, которые используют информацию о пути PANTHER для анализа генов выражение экспериментальные данные.

Ключевые слова: база данных путей , онтология, системная биология, биоинформатика, эволюция, классификация белков, анализ экспрессии генов

1. Введение

При наличии полных последовательностей генома от различных модельных организмов, и увеличивая экспериментальные данные и литературу, становится очевидным, что система подход нужен для биологических исследований.Такой подход позволит нам уйти за пределами отдельных генов, и изучить, как несколько белков работают вместе в комплексе биологической системы, то есть того, как белки взаимодействуют и регулируют друг друга в биологических сети путей, и как они обмениваются данными внутри ячейки и сигнализируют между различными клетки. Следует также признать, что в такой подход. Во-первых, для упрощения обработки данных необходимо использовать компьютеры и программное обеспечение. обработка и анализ. Во-вторых, это потребует совместной работы нескольких групп с разными платформами, вычислительными или экспериментальными.В конечном итоге ученые должны интерпретировать результаты, а компьютеры и программное обеспечение будет там, чтобы облегчить процесс.

Одним из важнейших элементов такого подхода является стандартизированная структура данных. что и компьютер, и человек могут читать. В последние годы концепция использование онтологии было перенесено в биологические исследования. Создание Гена Консорциум онтологий и последующее формирование Open Biology Ontology Литейное производство было первым признаком того, что биологи готовы следовать таким стандарты.Хотя есть строгие последствия использования термина онтология, «Стандарты» созданы, особенно для сетей маршрутов, просто для обмен данными и другие вычислительные цели.

В этой главе мы сначала обсудим, как представлены в системной биологии, особенно важность использования онтологий или стандарты для сбора биологических знаний. Далее мы используем PANTHER Pathway как пример, чтобы проиллюстрировать, как на практике онтологии и стандарты играют роль в данных моделирование, ввод данных и отображение данных.Наконец, мы описываем использование таких систем. Мы также описываем вычислительные инструменты, которые используют информацию о пути PANTHER для анализировать экспериментальные данные по экспрессии генов.

2. Теория: представление биологических знаний

Мы обсуждаем, как представлены биологические знания, в частности, как онтологии и стандарты используются для сбора биологических знаний и представлены в форме, понятной как компьютерам, так и ученым.

2.1. Что такое онтология?

Онтология берет свое начало из древнегреческой философии.Это исследование бытие и существование, а также их основные категории и отношения между их. Это формальное структурирование знаний.

Современная онтология впервые была использована в информатике и информации наука. Он использовался в качестве модели данных для представления набора концепций в рамках область и отношения между этими концепциями. Это часто используется для рассуждения об объектах в этой области. В настоящее время он также используется как форма представление знаний в ряде областей, в том числе в искусственных интеллект, Sementic Web, программная инженерия, биомедицинская информатика, библиотечное дело и информационная архитектура.Современная онтология отличается из классической философской онтологии в том смысле, что она выражена в машиночитаемый формат, и что он оценивается с точки зрения полезности, а не правда.

Онтология состоит из континуантов (сущностей или вещей, которые существуют) и происходящие события (события, процессы или действия), каждое из которых описывается четыре основных элемента: индивиды (экземпляры), классы (концепции), атрибуты, отношения. Например, конкретная гексокиназа человека I типа (HXK1) является экземпляр класса молекулы под названием «гексокиназа» и его молекулярная масса, количество аминокислот и расположение в хромосоме будут атрибуты.Гексокиназа — это подтип другого класса молекул, называемых «Киназа»; следовательно, формальное онтологическое представление связь гексокиназа is_a киназа. Гексокиназа катализирует реакция фосфорилирования (событие), которая превращает глюкозу в глюкозо-6-фосфат, который является одной из реакций в пути гликолиза; следовательно, реакция фосфорилирования составляет частей из гликолиза. путь.

2.2. Онтологии для биологических знаний

Онтология генов (GO) была, вероятно, первой онтологией, которая была разработана как формальное представление биологических знаний (Ashburner et al.2003; Консорциум генных онтологий, 2006 г.). Он состоит из трех области знаний: молекулярная функция, биологический процесс, клеточный компонент. Молекулярная функция описывает активность, такую ​​как каталитическая или связывающая активность, которым генный продукт обладает на молекулярном уровне. Поскольку акцент Онтология молекулярных функций связана с действиями, она описывает действие, а не вещество; следовательно, молекулярные функции — это скорее происходящие, чем продолжающиеся (Смит и др., 2003). Другими словами, Молекулярные функции GO используются для описания событий, которые вызывают продукты генов. способна делать, но не вещественный аспект генных продуктов.Биологические происходят и процессы. Биологический процесс определяется как « серия событий, выполненных одной или несколькими упорядоченными сборками молекулярных функции ». Разница между молекулярной функцией и биологической процесс состоит в том, что первый охватывает биологию на местном, индивидуальном молекулярном уровне. уровень, в то время как последний охватывает биологию на всех более высоких уровнях, от метаболических пути к физиологии и даже поведению на уровне организма. Кроме того, биологический процесс отличается от пути тем, что он не представляет динамика и зависимости, которые необходимы для описания пути.Клеточные компоненты являются континуантами. Сотовый компонент описывает местоположение в уровень субклеточной структуры и комплекса макромолекул. Субклеточный структура может быть мембраносвязанными органеллами (например, митохондриями, эндоплазматическими ретикулум) или не связанный с мембраной субклеточный компартмент (например, цитозоль, плазматическая мембрана). Комплекс макромолекул обычно представляет собой белковый комплекс (например, протеасома или сплайсосома), который описывает место, где Молекулярная функциональная активность находится в многосубъединичной структуре (http: // www.geneontology.org/GO.doc.shtml).

Было указано, что хотя GO использует иерархию терминов, он не является истинной онтологией, потому что в ней отсутствуют определенные онтологические особенности, такие как реализация программного обеспечения и логическое выражение теорий, охватывающих Условия GO (Смит и др., 2003). Тем не менее, он обеспечивает структуру контролируемого словаря, который помогает биологов для аннотирования генов и генных продуктов.

2.3. Онтология пути и база данных

Первым примером вычислительного представления онтологии пути был база данных EcoCyc (Karp et al.1996; Keseler et al. 2005). В прошлом десятилетие было построено более 240 баз данных путей, которые в настоящее время доступно в Интернете (http://www.pathguide.org/). Существуют различные усилия, направленные на к установлению принятого стандарта или онтологии для представления данные пути. Данные о пути обычно включают три основных класса. Первый класс включает молекулы, участвующие в проводящих путях. Второй класс включает химические реакции, в которых участвуют эти молекулы. Третий класс описывает расположение реакций.Онтология пути должна не только представляют все эти три класса данных, но также фиксируют сложные отношения между ними. Например, молекула может быть связана с реакцией как реагент или продукт. Переход от реагента к продукту может быть под действием другой молекулы, называемой модификатором. Модификатор может оказывать различное эффекты перехода, такие как катализ, стимуляция, ингибирование или модуляция. Кроме того, взаимосвязь между реакциями и клеточными компоненты описывает расположение этих реакций.GO Биологический процесс онтология не подходит для представления таких данных, поскольку она не охватывает все динамические отношения в путях. В результате появилось два стандартных формата. в течение последних нескольких лет для представления онтологии молекулярных реакций и путей. Язык разметки системной биологии (SBML) (Hucka et al. al. 2003) возникла из сообщества вычислительной биологии и является Программно-независимый язык на основе XML, предназначенный для представления моделей путей вместе с параметрами и математическими правилами для количественного моделирования.BioPAX (Лучано 2005), с другой стороны, возникла из сообщества геномиков и была создана как формат обмена для данные пути. Он представляет собой модели пути вместе с последовательностями белков и идентификаторы генов.

Одной из ключевых особенностей обоих стандартов является то, что они представляют пути по биохимических реакций, поэтому подробные молекулярные события фиксируются в структурированной формат. Обычно это не проблема метаболических путей. Тем не менее Обычный способ представления сигнальных путей — использовать поток активности диаграммы.и представляют собой диаграммы, отображающие потоки активности две реакции активации, которые обычно встречаются в научных статьях. показывает типичный каскад MAPK, то есть Raf 1 активирует MEK, который впоследствии активирует MAPK. показывает активацию каспазы 6 каспазой 3. Подробные механизмы этих реакций не показаны на диаграмме, но скорее обсуждается в неструктурированном тексте. Следовательно, как видно из диаграммы, оба реакции выглядят одинаково. Однако механизмы реакций активации в эти две диаграммы совершенно разные.Raf1 и MEK активируют MEK и MAPK, соответственно, катализируя реакции фосфорилирования (), в то время как каспаза 3 активирует каспазу 6 посредством протеолитическое расщепление прокаспазы 6 с образованием зрелой активной формы каспазы 6 (). И SBML, и BioPAX будут захватить эти молекулярные события и сохранить их в формате структуры.

Два вида реакций пути

(A) и (C). Диаграммы реакций, отображающие потоки активности двух реакции активации, которые обычно используются в научных статьях.(B) и (D). Диаграммы, нарисованные в CellDesigner, отражающие различные молекулярные механизмы реакций активации, проиллюстрированные на (A) и (C), соответственно.

Конечно, схема путей является неотъемлемой частью пути. Хотя SBML и BioPAX предоставляют компьютеру удобные структуры для считывания пути информации, схема путей еще более привлекательна для человеческого глаза. Программного обеспечения необходимо разработать, чтобы он мог читать эти файлы и отображать диаграммы точно. Недавно появилась новая разработка под названием «Графическая нотация системной биологии». (SBGN), был запущен для создания стандарта графических обозначений для вычислительное моделирование в системной биологии (http: // www.sbgn.org/). CellDesigner — программа для редактирования пути что соответствует SBGN. Это позволяет кураторам фиксировать молекулярные события путь с контролируемыми графическими обозначениями и сохранить их в машиночитаемом формат, совместимый с SBML (Kitano 2003; Китано и др. 2005). и являются примерами реакций, вызванных CellDesigner. Однако мы также должны признать, что онтология — это очень новый концепция для биологов, которые являются конечными пользователями диаграмм путей. В Стандарт будет успешным только в том случае, если у него будет большая пользовательская база.Следовательно, отображение диаграммы в знакомой им форме побудит биологи использовать стандарт. Однако такой вид можно использовать только для отображения реакция посредством вычисления подробной информации, полученной онтология. PANTHER Pathway реализовал апплет, который будет читать файлы сгенерированный CellDesigner, и отображать диаграммы в двух представлениях: стандартном Представление CellDesigner и упрощенное представление. и являются упрощенными видами автоматически генерируется апплетом из и, соответственно.

суммирует несколько популярные базы данных путей. BioCyc (Карп и др. 2005) и база данных Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG) (Kanehisa et al. 2006; Kushida et al. 2006) больше сосредоточены на метаболических путей, при интеграции сетевых объектов с иерархиями (INOH) (Fukuda et al. 2004; Kushida et al. 2006) и преобразование сигналов Среда знаний (Gough 2002) сосредоточены только на сигнальных путях. Остальные базы данных путей включают оба метаболические и сигнальные пути.Все базы данных, кроме изобретательности База знаний Pathways поддерживает один или оба формата SBML и BioPax. Однако BioCarta, KEGG и STKE отображают диаграммы реляционных путей, которые показывает потенциальное несоответствие между диаграммами и данными, полученными в спина. Это также показывает важность создания стандарта для графики. представление путей. Пути (кроме STKE) обычно связаны с белковые последовательности, которые связывают пути с информацией о геноме. Несколько базы данных также предоставляют инструменты для кураторства сообщества (BioCyc и PANTHER) и анализ данных (Изобретательность и ПАНТЕРА).

Таблица 1.

Сравнение баз данных путей

Тип пути

	BioCarta	BioCyc	Изобретательность	INOH	KEGG	PANTHER2	PANTHERID	M, S	M	M, S	S	Μ	M, S	M, S	M, S	S
Тип данных	Реляционная	Реакция	Реляционная	Реляционная и реакция	Реляционная	Реакция	Реакция	Реакция	Реляционная
Стандартный формат	Bio PAX	Bio PAX, NML /	SBML	Bio PAX	SBML	Bio PAX	BIO PAX, SBML 900 10	Bio PAX
связь с последовательностями белков	Да	Да	Да	Да	Да	Да	Да	Да	Нет
Ссылка на эволюцию Информация	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Литературные данные	Нет	Ссылка на реакцию	Ссылка на последовательность и реакцию	Н / Д	Ссылка на последовательность и реакцию		Ссылка на реакцию	Ссылка на реакцию
Инструменты общественного курирования	Нет	Да	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Инструменты анализа	Нет		Да	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Доступность	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для академических пользователей 9001 0	Плата за использование	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для всех пользователей	Бесплатно для академических пользователей
Ссылки	N / A	Karp et al., 2005	Н / Д	Fukuda et al. 2004; Kushida et al. 2006	Kanehisa et al. 2006	Mi et al., 2007	НЕТ	Joshi-Tope et al. al 2005	Gough 2002

3. Метод: PANTHER Pathway System

Мы используем PANTHER Pathway System в качестве практического примера, чтобы показать, как База данных путей построена для представления биологических знаний, а также того, как онтологии и стандарты играют роль в моделировании данных, вводе и отображении данных.

PANTHER (Анализ белков через эволюционные отношения) — это свободно доступная комплексная программная система для соотнесения эволюции белковой последовательности с эволюция специфических функций белков и биологических ролей (Mi et al. 2007). Ядро системы — большой коллекция филогенетически определенных семейств и подсемейств белков, созданных вычислительных алгоритмов и курируется опытными биологами с использованием обширного программная система для связывания терминов онтологии (Thomas et al.2003 г.). Каждое семейство или подсемейство белков представлено филогенетическое дерево, скрытая марковская модель (HMM) и многопоследовательное выравнивание (MSA). Семейные деревья белков построены с помощью вычислений на основе данных последовательности. Узлы в дереве, соответствующие общим предкам существующих членов семейства, являются аннотированы опытными биологами с их предполагаемыми молекулярными функциями и ролями в биологические процессы и пути, основанные на экспериментах, проведенных на сохранившихся белки. Эти аннотированные узлы определяют подсемейства белков, каждое из которых представлен HMM, чтобы позволить классифицировать недавно обнаруженные белковые последовательности ().

Филогенетическое дерево семейства белков PANTHER

На этом рисунке показан пример семейства белков PANTHER PTHR1537, a семейство потенциалзависимых калиевых каналов. Филогенетическое дерево было построено вычислительно из данных последовательности. (A) Дерево сворачивается, чтобы показать подсемейства как листовые узлы (узлы с голубыми ромбами). Узлы подсемейства соответствуют общие предки существующих членов семьи, и аннотированы экспертом биологов с их предполагаемыми молекулярными функциями и ролью в биологических процессы и пути, основанные на экспериментах, проведенных с существующими белками.Каждый подсемейство представлено скрытой марковской моделью (HMM), позволяющей классифицировать недавно обнаруженных белковых последовательностей. (B) Подмножество дерева (под красной стрелкой в (A)) раскрывается, чтобы показать индивидуальную обучающую последовательность, которая используется для построить семейную многопоследовательность, а также семью и подсемейство HMMs.

PANTHER Pathway — один из модулей PANTHER (Mi et al. 2007). Все пути подготовлены экспертами с помощью программного модуля PANTHER Pathway Curation (см. ниже).Они представлены онтологией пути, хранящейся в формате SBML и отображаемой в диаграммах с Апплет CellDesigner (обсуждается позже).

3.1. Структура пути PANTHER

Онтология пути PANTHER использует контролируемый словарь для описания пути, их компоненты и отношения между ними. ПАНТЕРА Онтология пути состоит из четырех основных классов.

3.1.1. Класс пути

Класс пути — это событие, которое представляет концепцию и область применения каждого пути.Объем путей аналогичен описанным в учебники или обзорные статьи. Обычно он очень хорошо определяется в метаболических процессах. пути, но гораздо меньше сигнальных (или регуляторных) путей. Например, сигнальный каскад киназы MAP во многих случаев, но это также сигнальный модуль в некоторых специфических путях, таких как в качестве пути передачи сигналов апоптоза, пути ангиогенеза или пути р53. В ПАНТЕРА, пути максимально репрезентативны и инклюзивны, особенно для сигнальных путей.Класс пути связан с следующие атрибуты:

1. Имя пути — обычно это имя обычно упоминается биологами в этой области.

2. Определение — описание пути.

3. Если путь достаточно хорошо установлен, чтобы появиться в учебнике обычно достаточно ссылки на учебник. В противном случае нам потребуется как минимум три ссылки для поддержки общая структура и границы пути.

3.1.2. Класс молекул

Класс молекул — это континуент, который представляет определенный класс молекулы, которые играют ту же механистическую роль в пути. Есть пять подклассов молекул: белки, гены / ДНК, РНК, простые молекулы (малые органическая, неорганическая или синтетическая молекула) и ионы. Если молекула — это белок, ген или транскрибируемая РНК, он связан с последовательностями белка в генеалогических деревьях белков PANTHER путем ручного выращивания (см. ниже). В отдельные белковые последовательности являются экземплярами класса молекул.В этих случаях класс молекул обычно представляет собой группу гомологичных / ортологичных белки различных организмов, которые участвуют в одних и тех же специфических биохимические реакции в рамках пути, например, класс молекул «PLC» (фосфолипаза C) в пути «Ангиотензин II-стимулированная передача сигналов через G-белки и бета-аррестин » включает различные подтипы PLC-beta (PLC-beta 1, PLC-beta 2, PLC-beta 3) у позвоночных (). Кроме того, он также связан со следующими атрибутами:

1. Имя — имя, которое появляется на пути диаграмма.Обычно это аббревиатура или сокращенная версия полной имя, например, MAPK.

2. Полное имя — полное, более информативное версия названия, например, митоген-активированная протеинкиназа.

3. Синонимы — все остальные названия, используемые для описания класс молекул, например MAP-киназа.

4. Определение — Краткое описание молекулы учебный класс.

5. Справочная информация — Литературные ссылки, обычно OMIM записи или обзорные статьи, фиксируются на этом уровне, чтобы поддерживают участие класса молекул в пути.Однако это не требование. Больше ссылок захвачено когда последовательности связаны с классом молекул.

Данные по экспрессии генов из Сопоставленные списки генов Инструмент просмотрен на Сайт ПАНТЕРА.

(A) Результаты, полученные с помощью инструмента «Сравнить списки генов». Два примерных списка были загружены в инструмент, List_A и List_B. Список человеческих генов NCBI был использован в качестве список литературы. (B) Результаты пути ангиогенеза показывают молекулу классы присутствуют только в List_A (красный), List_B (зеленый) или обоих (желтый).

3.1.3. Класс реакции и взаимосвязи

Класс реакции — это событие, представляющее биохимический отношения между различными классами молекул. Он похож на набор классы перехода молекулярных состояний из SBGN. Типичные примеры включают переход, транспорт, комплексообразование / диссоциация, катализ, модуляция, стимуляция активации / ингибирования транскрипции и т. д. на.

На основе реакций мы устанавливаем отношения между различными классы молекул.Например, если киназа катализирует переход белок из нефосфорилированного состояния в фосфорилированное состояние, киназа находится выше по течению и фосфорилирует белок. Типичные отношения включают вышестоящие, последующие фосфорилаты, дефосфорилаты, ацетилаты, убиквитинаты и метилаты.

3.1.4. Тип клетки или класс субклеточного компартмента

Это континуент, представляющий место (а), где происходит реакция имеет место. Каждый класс молекул и класс реакций обычно связаны с конкретный тип клеток или субклеточный компартмент.В настоящее время тип ячейки или компонент — это произвольный текст, введенный куратором, но мы в процессе принудительного использования терминов онтологии клеточных компонентов из Гена Онтология.

3.2. PANTHER Pathway Curation

3.2.1. Программный модуль курирования PANTHER Pathway

Модуль курирования PANTHER Pathway — еще один свободно доступный инфраструктура для поощрения ученых из сообщества к участию и внести свой вклад в работу по наставлению путей и поделиться знаниями.Там три основных свойства, которые отличают эту инфраструктуру от других системы курирования пути, такие как от Reactome (Joshi-Tope et al. 2005) и EcoCyc (Keseler et al. 2005). Во-первых, диаграммы путей составлены с помощью программного обеспечения CellDesigner (Kitano 2003; Kitano et al. 2005). Есть два преимущества использования CellDesigner. Во-первых, контролируемые графические обозначения используются для рисования диаграмму пути, и программное обеспечение автоматически создает вычислительную представление, совместимое со стандартом SBML.Во-вторых, путь диаграмму можно просмотреть с точным, взаимно однозначным соответствием с онтологическое представление путей, хранящихся в бэк-энде. В Второе свойство состоит в том, что область пути определяется сначала на основе литературе, и компоненты пути (белки, гены, РНК) рассматриваются как термины онтологии или классы молекул, а не конкретные экземпляры. Этот означает, что несколько белков из одного и того же организма или разных организмов потенциально может играть ту же роль в пути.Преимущество в том, что рабочий процесс больше похож на мыслительный процесс биологов, которые являются пользователями нашего программного модуля курирования. Третье важное свойство — что программное обеспечение курирования разработано так, чтобы быть достаточно простым для использования непосредственно лабораторными биологами после краткого курса обучения. Все остальные Известные нам базы данных Pathway нанимают высококвалифицированных кураторов, которые Конечно, нельзя быть специалистами во всех областях биологии. Текущий набор PANTHER pathways курировали более 40 различных внешних экспертов из научное сообщество; они должны были только продемонстрировать свой опыт с публикациями в соответствующей области.

3.2.2. Процесс курирования PANTHER Pathway

Процесс курирования PANTHER Pathway был тщательно разработан, чтобы фиксировать молекулярные события и биохимические реакции путей. В Процесс курирования делится на два этапа. Первый этап — создание диаграмма путей и онтология. CellDesigner используется как путь инструмент редактирования для куратора, чтобы нарисовать схему пути. Знания захваченный на диаграмме точно сохраняется в машиночитаемом файле который совместим с SBML.Ссылки на литературу должны быть предоставлены для путь. Как упоминалось ранее, если путь не установлен в учебник, например, многие из классических метаболических путей, все пути требуется не менее трех литературных ссылок. Затем файл пути анализируется компьютерной программой для создания онтологии пути, которая хранится в базе данных курирования PANTHER Pathway, реализованной в Oracle. Второй этап — этап аннотации последовательности, на котором куратор работает с прямым веб-интерфейс к базе данных курирования.Если молекула пути представляет собой белок, ген или транскрипт, он связан с белковыми последовательностями в PANTHER базы данных, которые используются для построения генеалогических деревьев белков PANTHER, и модели семейства и подсемейства HMM (). Интерфейс отображает каждый из классов молекул (термины) которые соответствуют белку, мРНК или гену. На данный момент это просто термины, которые куратор использовал для именования классов в CellDesigner схема пути. Система позволяет кураторам искать тренинги. последовательности, основанные на термине класса молекул и вручную связывающие последовательности к термину онтологии ().Для каждой аннотации необходимо выбрать доверительный код из список, определенный Консорциумом генных онтологий, и идентификатор PubMed источник литературных ссылок в качестве доказательства (см. ниже). Кураторы разрешено связывать ортологичные или даже паралогичные последовательности с класс молекулы без экспериментальных доказательств, используя ISS (выведенный сходство последовательностей) код свидетельства.

Связывание классов молекул пути с подсемействами в филогенетической дерево.

(A) Класс молекулы фосфолипазы C (PLC, желтого цвета) в Передача сигналов, стимулированная ангиотензином II, через G-белок и бета-аррестин (PANTHER accession {«type»: «entrez-protein», «attrs»: {«text»: «P05911», «term_id»: «135374», «term_text»: «P05911»}} P05911).(A) Филогенетическое дерево подсемейств фосфолипазы C (Номер PANTHER PTHR10336: SF10 — SF12). Интерфейс веб-курирования построен для позволяют опытным биологам связать последовательности тренировок белков дерева с класс молекул. Для каждой аннотации необходимо выбрать доверительный код из список, определенный Консорциумом генных онтологий, и идентификатор PubMed источник литературных ссылок в качестве доказательства.

3.2.3. Литература и справочные материалы

Справочные материалы фиксируются на трех уровнях.Во-первых, каждый путь как все требует ссылки. Для сигнальных путей не менее трех ссылки, обычно обзорные статьи, необходимы для того, чтобы предоставить более подробную информацию. объективное представление о размахе пути. Для метаболических путей a ссылки на учебник обычно достаточно. Во-вторых, ссылки часто связаны с каждым классом молекул в пути. Большинство этих ссылок являются записями OMIM или обзорами. В-третьих, приводятся ссылки на поддержку ассоциация конкретных белковых последовательностей с определенным классом молекул, е.g., последовательность SWISS-PROT P53_HUMAN, аннотированная как экземпляр молекула класса «P53», появляющаяся в классе пути «Путь P53». Обычно это исследовательские работы, в которых экспериментальные доказательства того, что конкретный белок или ген участвует в реакции, представленные на диаграмме пути.

4. Использование: Инструменты анализа экспрессии генов PANTHER

Мы обсудили важность использования онтологии для получения знаний. представление биологических данных. Мы также используем путь PANTHER в качестве примера, чтобы показать как такие стандарты и онтология используются на практике для фиксации биологических знание.Конечная цель создания такой инфраструктуры — использовать ее для эффективный и надежный анализ данных биологических исследований. ПАНТЕРА предоставляет ряд приложений и услуг, чтобы помочь нашим пользователям в их исследованиях (Томас и др., 2006). Один из них — приложение для анализа экспрессии генов, предназначенное для поиска статистически значимых ассоциации между результатами экспериментов по экспрессии генов и функцией генов.

4.1. Инструмент сравнения генов

Этот инструмент концептуально основан на описанном простом биномиальном тесте. ранее (Cho et al.2000). Вход список разделен на группы по классификации PANTHER (либо молекулярные, либо молекулярные). функция, биологический процесс или путь). Можно загрузить до четырех списков для каждого анализа. Список литературы, который обычно содержит все гены / белки, из которых был составлен список, делятся на группы одинаковыми способ. PANTHER предоставляет списки людей и мышей NCBI в качестве справочных списков по умолчанию, поэтому загрузка списка литературы не является обязательной. Затем для каждой функциональной категории например, протеинкиназа для молекулярной функции, пролиферация клеток для биологической процесс, или сигнальный путь апоптоза для пути, биномиальный тест применяется для определения наличия статистического превышения или недопредставленность генов / белков во входном списке по сравнению с список литературы.

Входные файлы или справочный файл должны быть в одном из двух форматов. Если пользователь желает использовать предварительно рассчитанные данные оценки HMM, хранящиеся в PANTHER веб-сайт, формат — это просто файл с одним столбцом идентификаторов, которые могут указать записи в базе данных PANTHER. В настоящее время предварительно рассчитанные данные охватывает только геномы человека, мыши, крысы и Drosophila . В поддерживаемые идентификаторы включают идентификаторы генов (Entrez Gene (Pruitt et al. 2001) для человека, мыши и крысы или FlyBase (Консорциум FlyBase 2003; Wilson et al.2008) Номера FBgn для Drosophila ), идентификаторы белков (RefSeq или FlyBase) и генные символы. Если пользователь желает использовать файл, созданный путем оценки этого собственные белковые последовательности пользователя против HMM семейства / подсемейства PANTHER (доступно для загрузки на http://www.pantherdb.org/downloads), «Общий файл сопоставления »должен использоваться вместо этого. Этот формат состоит из двух столбцы: первый столбец может быть идентификатором любого типа, используемым для оценки; в второй столбец — это идентификатор PANTHER HMM (e.g., PTHR10000 или PTHR10000: SF1), который используется для поиска молекулярных функций, биологических процессов и путей ассоциации.

Результатом инструмента является список значений P для недо- или избыточное представление каждой функциональной категории в каждом из входных списков (). На этой странице вывода пользователь может экспортировать статистику или переходить по ссылкам для графического просмотра (как круговая диаграмма диаграммы или гистограммы) данные, используемые для вычисления P-значений или для просмотра список генов / белков в любой функциональной группе.Когда пути выбраны в качестве функциональные категории, щелчок по названию пути вызывает диаграммы путей окрашены в соответствии с предпочтениями, указанными пользователем (Firgure 4B).

4.2. Анализировать список со значениями экспрессии генов

Этот инструмент предназначен для анализа полного списка генов / белков, которые имеют числовые данные, связанные с каждым геном / белком. Числовые данные могут быть нормализованные необработанные показания экспериментов с микрочипами или, чаще, значение кратного изменения для каждого гена в эксперименте по дифференциальной экспрессии.В статистический тест является достаточно общим, чтобы обрабатывать любые числовые данные, непрерывные или прерывистый. Во-первых, эталонное распределение генерируется статистическим инструмент, использующий все значения для всех входных данных в списке, а затем распределения для каждая функциональная категория сформирована. Вероятность того, что функционал распределение категорий было выбрано случайным образом из эталонного распределения. оценивается с помощью критерия суммы рангов Манна-Уитни (U-критерий) (Кларк и др., 2003). Этот инструмент предоставляет больше чувствительный тест, чем простой тест на основе списка, описанный в разделе 4.1.

Для этого теста нужен только один входной файл. Подобно тем, что в инструмент сравнения списков (раздел 4.1), есть два формата загруженного файла, в зависимости от желаемого источника данные классификации PANTHER: либо предварительно рассчитанные классификации доступны на сайте PANTHER или в файле, созданном пользователем. Для использования предварительно рассчитанные данные PANTHER, файл должен содержать два столбца: первый — это идентификатор гена или белка, а второе — числовое значение. Для данные, указанные пользователем, файл должен содержать три столбца: произвольное отслеживание идентификатор (e.g., идентификатор или символ гена UniProt), PANTHER HMM идентификатор, указывающий на классификацию гена / белка, и числовой стоимость.

Результатом инструмента является список значений P для каждого сравнения между распределение функциональных категорий и справочное распределение (). Каждая раздача, и как это сравнивается с эталонным распределением, можно просмотреть графически из страница вывода. Мы считаем, что это очень важно для интерпретации любых отклонений. между распределением функциональных категорий и общим распределением ().Гены / белки в каждом категорию также можно просмотреть на странице вывода, щелкнув перечисленные подсчитывает. Кроме того, для путей щелчок по названию пути вызовет интерактивный Java-апплет, который раскрашивает путь с помощью «тепловой карты» полученный из входных значений ().

Данные по экспрессии генов из Анализ списка генов с геном средство выражения значений просмотрено на веб-сайте PANTHER.

(A) Вывод инструмента со списком P-значений для каждого сравнения между распределением функциональных категорий и эталонным распределением.(В) Сравнение распределений сигнального пути активации Т-клеток (красный) и ссылка (синяя) в виде графика. (C) Схема путей активации Т-клеток сигнальный путь, который визуализируется с помощью интерактивного JAVA-апплета пути который окрашивает путь, используя «тепловую карту», ​​полученную на основе входных данных значения.

5. Примечания

В обоих инструментах анализа экспрессии генов пользователи могут загружать файлы двух типов. Формат файла, который поддерживает предварительно рассчитанную классификацию PANTHER, прост и легко использовать.Не требует подсчета очков и создания файла классификации. Однако его ограничение состоит в том, что можно использовать только четыре организма и несколько типов идентификаторов. при поддержке PANTHER. Многие исследователи используют платформы microaray, которые используют идентификаторы, отличные от Entrez ID или RefSeq. Иногда это могло быть сочетание разные типы идентификаторов в одном файле. Многие из наших пользователей не биоинформатикам, поэтому они не осведомлены о различиях между всеми разные типы удостоверений личности. На странице результатов мы показываем, сколько последовательностей на самом деле сопоставлен с предварительно рассчитанной классификацией PANTHER.Если несопоставленные идентификаторы закончились 20% весьма вероятно, что во входном файле указаны неверные типы идентификаторов.

Если идентификаторы из входного файла принадлежат одному из четырех организмов поддерживается PANTHER (человек, мышь, крыса и муха), но не поддерживаемые типы Идентификаторы, пользователь может преобразовать их в один из поддерживаемых типов, используя некоторые общедоступные инструменты. Одним из инструментов является IDmapper, разработанный Европейским институтом биоинформатики (EBI). и на своем веб-сайте UniProt (http://www.pir.uniprot.org/search/idmapping.штмл).

Если идентификаторы из входного файла получены от организмов, отличных от четыре организма, поддерживаемые PANTHER, пользователь должен оценить их по PANTHER HMM и сгенерируйте классификацию (Thomas et al. 2006).

4. Ссылки

• Ashburner M, Mungall CJ, Lewis SE. Онтологии для биологов: модель сообщества для аннотация геномных данных. Колд Спринг Харб Симп Квант Биол 2003; 68: 227–35. [PubMed] [Google Scholar]
• Чо Р.Дж., Кэмпбелл М.Дж.Транскрипция, геномы, функции. Тенденции Genet 2000; 16 (9): 409–15. [PubMed] [Google Scholar]
• Clark AG, Glanowski S, Nielsen R и другие. Вывод ненейтральной эволюции из ортолога человек-шимпанзе-мышь генные трио. Наука 2003; 302 (5652): 1960–3. [PubMed] [Google Scholar]
• Консорциум FlyBase. База данных FlyBase проектов генома дрозофилы и общественная литература. Нуклеиновые кислоты Res 2003; 31 год (1): 172–5. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Фукуда К.И., Ямагата Ю., Такаги Т.FREX: интерфейс запросов для биологических процессов с иерархические и рекурсивные структуры. В Силико Биол 2004; 4 (1): 63–79. [PubMed] [Google Scholar]
• Онтология генов Консорциум. Проект Gene Ontology (GO) в 2006 г. Нуклеиновые кислоты Res 2006; 34 (База данных выпуск): D322–6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Gough NR. Научные знания о преобразовании сигналов среда: база данных карт соединений. Ann N Y Acad Sci 2002; 971: 585–7. [PubMed] [Google Scholar]
• Хука М., Финни А., Сауро Х.М. и другие.Язык разметки системной биологии (SBML): среда для представление и обмен моделями биохимических сетей. Биоинформатика 2003; 19 (4): 524–31. [PubMed] [Google Scholar]
• Джоши-Топе Дж., Гиллеспи М., Вастрик И. и другие. Reactome: база знаний о биологических путях. Нуклеиновые кислоты Res 2005; 33 (База данных выпуск): D428–32. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Канехиса М., Гото С., Хаттори М. и другие. От геномики к химической геномике: новые разработки в КЕГГ. Нуклеиновые кислоты Res 2006; 34 (База данных выпуск): D354–7.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Karp PD, Ouzounis CA, Moore-Kochlacs C и другие. Расширение коллекции BioCyc баз данных путей / геномов до 160 геномов. Нуклеиновые кислоты Res 2005; 33 (19): 6083–9. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Karp PD, Riley M, Paley SM и другие. EcoCyc: энциклопедия генов Escherichia coli и метаболизм. Нуклеиновые кислоты Res 1996; 24 (1): 32–9. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Кеселер И.М., Колладо-Видес Дж., Гама-Кастро С. и другие.EcoCyc: обширная база данных по Escherichia coli. Нуклеиновые кислоты Res 2005; 33 (База данных выпуск): D334–7. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Kitano H Графическое обозначение биохимических сетей. Biosilico 2003; 1: 169–76. [Google Scholar]
• Китано Х., Фунахаши А., Мацуока Ю. и другие. Использование диаграмм процессов для графического представления биологические сети. Nat Biotechnol 2005; 23 (8): 961–6. [PubMed] [Google Scholar]
• Кушида Т., Такаги Т., Фукуда К.И.Онтология событий: онтология, ориентированная на пути биологические процессы. Пак Симп Биокомпьютер 2006: 152–63. [PubMed]
• Лучано Дж. С.. PAX ума для исследователей путей. Drug Discov сегодня 2005; 10 (13): 937–42. [PubMed] [Google Scholar]
• Mi H, Guo N, Kejariwal A и другие. PANTHER версия 6: данные об эволюции последовательности и функции белков с расширенным представлением биологических путей. Нуклеиновые кислоты Res 2007; 35 год (База данных выпуск): Д247–52. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Прюитт К.Д., Маглотт Д.Р.RefSeq и LocusLink: ген-центрированный NCBI Ресурсы. Нуклеиновые кислоты Res 2001; 29 (1): 137–40. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Смит Б., Уильямс Дж., Шульце-Кремер С. Онтология генной онтологии. AMIA Annu Symp Proc 2003: 609–13. [Бесплатная статья PMC] [PubMed]
• Thomas PD, Campbell MJ, Kejariwal A и другие. PANTHER: библиотека семейств и подсемейств белков, индексируемая функция. Genome Res 2003; 13 (9): 2129–41. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Thomas PD, Kejariwal A, Guo N и другие.Приложения для данных эволюции последовательности-функции белка: Анализ экспрессии мРНК / белков и оценка кодирующих SNP инструменты. Нуклеиновые кислоты Res 2006; 34 (Веб сервер выпуск): W645–50. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
• Уилсон Р. Дж., Гудман Дж. Л., Стрелец В. Б.. FlyBase: интеграция и улучшения запросов инструменты. Нуклеиновые кислоты Res 2008; 36 (База данных выпуск): D588–93. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

Федеральный грант в размере 10 миллионов долларов США расширяет исследования по защите от сотрясений мозга

ПРОВИДЕНС, Р.I. [Университет Брауна] — Несмотря на растущую озабоченность по поводу сотрясений мозга у спортсменов, солдат и других людей, эти травмы по-прежнему крайне сложно предотвратить или даже диагностировать.

Исследовательское сотрудничество, включающее трех профессоров Университета Брауна, работает над всеобъемлющим пониманием черепно-мозговой травмы, связывая повреждение, происходящее на клеточном уровне в головном мозге, с силами и движениями, связанными с ударами по голове. Сотрудничество, названное PANTHER, в конечном итоге направлено на разработку новых способов обнаружения сотрясения мозга и новых технологий шлемов, которые лучше защищают от них.

Теперь эта работа будет расширяться благодаря новому гранту в размере 10 миллионов долларов от Управления военно-морских исследований Министерства военно-морского флота США.

«Сотрясение мозга — это коварные травмы, потому что часто нет внешних признаков того, что травма произошла», — сказал Ханиш Кесари, доцент инженерной школы Брауна, который работает над проектом с другими преподавателями Дайан Хоффман-Ким и Дэвидом Хенанном. «Таким образом, существует необходимость в поиске новых методов обнаружения, а это требует лучшего понимания механизмов, лежащих в основе этих травм.Это то, что мы пытаемся сделать ».

PANTHER возглавляет Кристиан Франк, профессор Университета Висконсин-Мэдисон, который запустил проект в Брауне в 2017 году, когда он был профессором инженерной школы. Франк разрабатывает новые методы визуализации повреждений отдельных клеток после травмы и работает над точным количественным определением сил, необходимых для нанесения этого повреждения.

Хоффман-Ким, доцент медицинских наук и инженерии, работает над тем, чтобы вывести исследования отдельных клеток Франка на уровень кластеров клеток.Она работает с мини-мозгом, трехмерными культурами клеток мозга, которые имитируют основные функции настоящего мозга. Используя мини-мозг, исследователи надеются узнать больше о химических сигналах, которыми обмениваются клетки в ответ на травму. Эти сигнальные пути потенциально могут служить средством обнаружения сотрясения мозга.

«Мини-мозг — это на самом деле просто клубок клеток, но у них есть электрическая активность, капиллярные сети, и они надежно аппроксимируют плотность клеток и жесткость мозга, что имеет отношение к тому, что мы изучаем», — сказал Хоффман-Ким. , который связан с Брауновским институтом исследований мозга Карни.«Благодаря сотрудничеству с PANTHER мы сможем использовать мини-мозг для обнаружения травм в режиме реального времени и управления биохимическими сигналами, которые возникают по мере прогрессирования травмы».

Кесари и Хенанн будут работать над вычислительными методами, которые связывают внутренние клеточные повреждения с внешними стрессами и напряжениями. Цель состоит в том, чтобы создать высокоточные компьютерные модели головы, шеи и мозга, которые могут фиксировать динамику травм как внутри мозга, так и за его пределами.

«Работа Дайан и Кристиана говорит нам о том, какое напряжение или напряжение внутри мозга приводят к травмам», — сказал Кесари.«Тогда возникает вопрос: если футболист бежит по полю и получает удар, как эта внешняя сила трансформируется во внутреннее напряжение? Так что моя работа — связать эти физические движения с напряжениями внутри мозга ».

В конце концов, команда хотела бы разработать датчики, которые можно было бы разместить внутри шлемов и которые могли бы обнаруживать удары, наносимые с достаточной силой, чтобы вызвать внутренние повреждения.

«Вы можете думать об этом как о Fitbit для головы», — сказал Кесари. «Идея состоит в том, что вы все время контролируете ситуацию, поэтому, когда происходит разрушительное воздействие, вы можете немедленно вмешаться.”

Команда также работает с отраслевым партнером, производителем шлемов Team Wendy, чтобы преобразовать новую информацию о процессе сотрясения мозга в новые шлемы, которые лучше предотвращают травмы головного мозга.

Хоффман-Ким говорит, что она счастлива быть частью проекта, который может помочь такому количеству людей.

«Я мама двух мальчиков, которые всю школу занимались спортом», — сказала она. «Я думаю, многие из нас слышали:« Нет, мама, все в порядке; Я могу вернуться на поле.Но мы знаем, что повторные черепно-мозговые травмы могут вызвать долгосрочные проблемы. Если нам удастся добиться прогресса в выявлении первоначальной травмы, мы надеемся предотвратить некоторые из этих долгосрочных проблем ».

Эпигеномные и метаболические ответы нейронов POMC гипоталамуса на воздействие гестационного никотина у взрослых потомков | Геномная медицина

Биосинтез 2-арахидоноилглицерина (P05726)	4	0.00%	0,10%
Биосинтез 5-гидрокситриптамина (P04371)	2	0,00%	0,00%
Разложение 5-гидрокситриптамина (P04372)	3	0.00%	0,10%
Сигнальный путь, опосредованный рецептором 5HT1-типа (P04373)	25	0,20%	0,60%
Сигнальный путь, опосредованный рецептором 5HT2-типа (P04374)	39	0.30%	1,00%
Сигнальный путь, опосредованный рецептором 5HT3-типа (P04375)	12	0,10%	0,30%
Сигнальный путь, опосредованный рецептором 5HT4-типа (P04376)	16	0.10%	0,40%
Утилизация ацетата (P02722)	3	0,00%	0,10%
Сигнальный путь активина-бета (P06210)	3	0.00%	0,10%
Путь спасения аденина и гипоксантина (P02723)	6	0,10%	0,10%
Биосинтез адреналина и норадреналина (P00001)	22	0.20%	0,50%
Биосинтез аланина (P02724)	2	0,00%	0,00%
ALP23B_signaling_pathway (P06209)	3	0.00%	0,10%
Путь передачи сигналов альфа-адренорецептора (P00002)	20	0,20%	0,50%
Путь амилоидсекретазы болезнь Альцгеймера (P00003)	50	0.40%	1,20%
Путь болезни Альцгеймера к пресенилину (P00004)	74	0,60%	1,80%
Разложение аминопутирата (P02726)	2	0.00%	0,00%
Биосинтез андрогенов / эстрогенов / прогестерона (P02727)	3	0,00%	0,10%
Ангиогенез (P00005)	125	1.10%	3,10%
Передача сигналов, стимулированная ангиотензином II, через G-белки и бета-аррестин (P05911)	30	0,30%	0,70%
Сигнальный путь апоптоза (P00006)	80	0.70%	2,00%
Биосинтез аргинина (P02728)	4	0,00%	0,10%
Разложение аскорбата (P02729)	2	0.00%	0,00%
Биосинтез аспарагина и аспартата (P02730)	4	0,00%	0,10%
Синтез АТФ (P02721)	6	0.10%	0,10%
Направление аксонов, опосредованное нетрином (P00009)	29	0,30%	0,70%
Направление аксонов, опосредованное семафоринами (P00007)	18	0.20%	0,40%
Направление аксонов, опосредованное Slit / Robo (P00008)	18	0,20%	0,40%
Активация В-клеток (P00010)	49	0.40%	1,20%
Путь передачи сигналов бета1-адренорецептора (P04377)	26 год	0,20%	0,60%
Путь передачи сигналов бета2-адренорецептора (P04378)	26 год	0.20%	0,60%
Путь передачи сигналов бета3-адренорецептора (P04379)	11	0,10%	0,30%
Свертывание крови (P00011)	22	0.20%	0,50%
BMP_signaling_pathway-дрозофила (P06211)	2	0,00%	0,00%
Сигнальный путь кадгерина (P00012)	103	0.90%	2,50%
Карнитин и метаболизм КоА (P02732)	1	0,00%	0,00%
Метаболизм карнитина (P02733)	1	0.00%	0,00%
Клеточный цикл (P00013)	17	0,10%	0,40%
Биосинтез холестерина (P00014)	9	0.10%	0,20%
Система циркадных часов (P00015)	9	0,10%	0,20%
Биосинтез коэнзима А (P02736)	6	0.10%	0,10%
Путь передачи сигналов рецептора рилизинг-фактора кортокотропина (P04380)	27	0,20%	0,70%
Биосинтез цистеина (P02737)	1	0.00%	0,00%
Регуляция цитоскелета с помощью Rho GTPase (P00016)	57 год	0,50%	1,40%
Биосинтез пуринов de novo (P02738)	19	0.20%	0,50%
Биосинтез пиримидиндезоксирибонуклеотида de novo (P02739)	6	0,10%	0,10%
Биосинтез пирмидин-рибонуклеотидов de novo (P02740)	8	0.10%	0,20%
Репликация ДНК (P00017)	19	0,20%	0,50%
Сигнальный путь, опосредованный дофаминовым рецептором (P05912)	48	0.40%	1,20%
DPP_signaling_pathway (P06213)	2	0,00%	0,00%
DPP-SCW_путь_сигнализации (P06212)	2	0.00%	0,00%
Путь передачи сигналов рецептора EGF (P00018)	101	0,90%	2,50%
Эндогенный каннабиноидный сигнал (P05730)	18	0.20%	0,40%
Сигнальный путь эндотелина (P00019)	65	0,60%	1,60%
Выпуск энкефалина (P05913)	17	0.10%	0,40%
Сигнальный путь FAS (P00020)	24	0,20%	0,60%
Сигнальный путь FGF (P00021)	86	0.70%	2,10%
Биосинтез флавинов (P02741)	2	0,00%	0,00%
Биосинтез фолиевой кислоты (P02742)	2	0.00%	0,00%
Биосинтез формилтетрагидроформиата (P02743)	4	0,00%	0,10%
Метаболизм фруктозы и галактозы (P02744)	9	0.10%	0,20%
GABA-B_receptor_II_signaling (P05731)	30	0,30%	0,70%
Синтез гамма-аминомасляной кислоты (P04384)	5	0.00%	0,10%
GBB_signaling_pathway (P06214)	2	0,00%	0,00%
Общая транскрипция РНК-полимеразой I (P00022)	13	0.10%	0,30%
Общая регуляция транскрипции (P00023)	30	0,30%	0,70%
Превращение глутамина в глутамат (P02745)	2	0.00%	0,00%
Гликолиз (P00024)	18	0,20%	0,40%
Путь рецептора рилизинг-гормона гонадотропина (P06664)	185	1.60%	4,60%
Сигнальный путь Hedgehog (P00025)	19	0,20%	0,50%
Биосинтез гема (P02746)	8	0.10%	0,20%
Гетеротримерный путь передачи сигналов G-белка — путь, опосредованный Gi альфа и Gs альфа (P00026)	103	0,90%	2,50%
Гетеротримерный путь передачи сигналов G-белка — путь, опосредованный Gq альфа и Go (P00027)	86	0.70%	2,10%
Гетеротримерный путь передачи сигналов G-белка — фототрансдукция наружного сегмента стержня (P00028)	17	0,10%	0,40%
Сигнальный путь, опосредованный гистаминовым рецептором h2 (P04385)	22	0.20%	0,50%
Сигнальный путь, опосредованный гистаминовым рецептором h3 (P04386)	9	0,10%	0,20%
Болезнь Хантингтона (P00029)	112	1.00%	2,80%
Ответ гипоксии через активацию HIF (P00030)	21 год	0,20%	0,50%
Воспаление, опосредованное сигнальным путем хемокинов и цитокинов (P00031)	135	1.20%	3,30%
Каскад киназы протеинкиназы, активируемой митогеном, пути инсулина / IGF / MAP-киназы (P00032)	26 год	0,20%	0,60%
Сигнальный каскад протеинкиназы B пути инсулина / IGF (P00033)	30	0.30%	0,70%
Интегрин сигнальный путь (P00034)	135	1,20%	3,30%
Путь передачи сигналов гамма-интерферон (P00035)	24	0.20%	0,60%
Путь передачи сигналов интерлейкина (P00036)	59	0,50%	1,50%
Ионотропный путь рецептора глутамата (P00037)	41 год	0.40%	1,00%
Биосинтез изолейцина (P02748)	3	0,00%	0,10%
Сигнальный путь JAK / STAT (P00038)	15	0.10%	0,40%
Биосинтез лейцина (P02749)	2	0,00%	0,00%
Липоат_биосинтез (P02750)	2	0.00%	0,00%
Метаболизм маннозы (P02752)	5	0,00%	0,10%
Путь метаботропных рецепторов глутамата группы I (P00041)	19	0.20%	0,50%
Путь метаботропных рецепторов глутамата группы II (P00040)	25	0,20%	0,60%
Путь метаботропных рецепторов глутамата группы III (P00039)	45	0.40%	1,10%
Биосинтез метионина (P02753)	2	0,00%	0,00%
Метилцитратный цикл (P02754)	2	0.00%	0,00%
Метилмалониловый путь (P02755)	3	0,00%	0,10%
сплайсинг мРНК (P00058)	6	0.10%	0,10%
Сигнальный путь мускариновых ацетилхолиновых рецепторов 1 и 3 (P00042)	38	0,30%	0,90%
Сигнальный путь мускариновых ацетилхолиновых рецепторов 2 и 4 (P00043)	29	0.30%	0,70%
Петли обратной связи пути P53 1 (P04392)	5	0,00%	0,10%
Петли обратной связи пути P53 2 (P04398)	41 год	0.40%	1,00%
Болезнь Паркинсона (P00049)	74	0,60%	1,80%
Путь передачи сигналов PDGF (P00047)	105	0.90%	2,60%
Пентозофосфатный путь (P02762)	7	0,10%	0,20%
Разложение фенилэтиламина (P02766)	1	0.00%	0,00%
Путь киназы PI3 (P00048)	40	0,30%	1,00%
Каскад активации плазминогена (P00050)	3	0.00%	0,10%
Биосинтез PLP (P02759)	1	0,00%	0,00%
Биосинтез пролина (P02768)	4	0.00%	0,10%
Метаболизм пуринов (P02769)	7	0,10%	0,20%
Путь утилизации пиридоксальфосфата (P02770)	1	0.00%	0,00%
Метаболизм пиримидина (P02771)	8	0,10%	0,20%
Метаболизм пирувата (P02772)	6	0.10%	0,10%
Ras Pathway (P04393)	61	0,50%	1,50%
Биосинтез S-аденозилметионина (P02773)	2	0.00%	0,00%
Спасательные пиримидин дезоксирибонуклеотиды (P02774)	1	0,00%	0,00%
Спасательные пиримидин рибонуклеотиды (P02775)	6	0.10%	0,10%
SCW_signaling_pathway (P06216)	2	0,00%	0,00%
Биосинтез серина глицина (P02776)	5	0.00%	0,10%
Превращение сукцината в пропионат (P02777)	2	0,00%	0,00%
Ассимиляция сульфатов (P02778)	2	0.00%	0,00%
Synaptic_vesicle_trafficking (P05734)	24	0,20%	0,60%
Активация Т-клеток (P00053)	58	0.50%	1,40%
Цикл TCA (P00051)	9	0,10%	0,20%
Сигнальный путь TGF-бета (P00052)	62	0.50%	1,50%
Метаболизм тиамина (P02780)	3	0,00%	0,10%
Биосинтез треонина (P02781)	2	0.00%	0,00%
Путь передачи сигналов рецептора рилизинг-гормона тиротропина (P04394)	35 год	0,30%	0,90%
Путь передачи сигналов рецептора Toll (P00054)	39	0.30%	1,00%
Toll_pathway_drosophila (P06217)	1	0,00%	0,00%
Регуляция транскрипции с помощью фактора транскрипции bZIP (P00055)	41 год	0.40%	1,00%
Метаболизм триацилглицерина (P02782)	1	0,00%	0,00%
Биосинтез триптофана (P02783)	1	0.00%	0,00%
Биосинтез тирозина (P02784)	1	0,00%	0,00%
Убиквитиновый протеасомный путь (P00060)	50	0.40%	1,20%
Биосинтез валина (P02785)	3	0,00%	0,10%
Синтез вазопрессина (P04395)	11	0.10%	0,30%
Путь передачи сигналов VEGF (P00056)	47	0,40%	1,20%
Метаболизм витамина B6 (P02787)	3	0.00%	0,10%
Метаболизм и метаболизм витамина D (P04396)	7	0,10%	0,20%
Сигнальный путь Wnt (P00057)	211	1.80%	5,20%
Путь спасения ксантина и гуанина (P02788)	4	0,00%	0,10%

26 акров земли Panther Island выходят на рынок, когда начинают разводиться мосты — Panther Island Central City

Роберт Фрэнсис

29 апреля 2021 г.

Двадцать шесть акров земли в комплексе Panther Island поступают на рынок.

Теперь, когда мост Белого поселения открыт, инфраструктура улучшена и скоро откроется многосемейное сообщество Encore Panther Island, LanCarte Commercial в сотрудничестве с Panther Island Property Group объявила, что крупнейший портфель частной земли на острове Пантера переходит в рынок.

Расположенный к северу от центра города Форт-Уэрт, на берегу реки Тринити, район, известный как Вверх по течению на острове Пантера, включает примерно 26 акров на десяти участках, подходящих для смешанного использования, офисов, многосемейных и торговых объектов, с будущие возможности набережной и обширный фасад.

По данным LanCarte Commercial, семь из десяти участков имеют фасад, который будет примыкать к планируемому каналу или набережной. Согласно пресс-релизу, в настоящее время участки 1-6 Upstream готовы к разработке. Разработка последних четырех участков будет соответствовать более поздним этапам совместного проекта по наводнению острова Пантера / Центрального города.

Марк Брок, управляющий партнер Lionhead Real Estate, крупнейшего частного инвестора на острове, сказал: «Мы очень рады сотрудничать с LanCarte в новой невероятной главе для Panther Island.Мы инвестировали в Panther Island более десяти лет, и, имея возможность наблюдать за прогрессом со стороны, заметное увеличение активности и завершение нескольких ключевых этапов развития за последние несколько месяцев сигнализируют нам о том, что «Момент настал».

В начале апреля открылся мост Белого поселения, а в июне откроется мост на Мэйн-стрит.

«Мы очень рады как Upstream, так и Panther Island», — сказала Сара Ланкарте из LanCarte Commercial.«Таких мест где-нибудь мало — возможность на набережной прямо через реку от горизонта (Форт-Уэрт). Время Panther Island пришло, и Upstream готова ускорить темпы развития ».

Как и предполагалось, проект на острове Пантера стоимостью 1,17 миллиарда долларов потребует рытье 1,5-мильного обходного канала и перенаправления реки Тринити к северу от здания суда округа Таррант. Этот канал добавит защиту от наводнений, а также выделит центральный остров площадью 800 акров, что создаст возможности для экономического развития на набережной, включая набережную в стиле Сан-Антонио.Хотя планы существуют уже некоторое время, федеральные средства, необходимые для завершения проекта, пока не реализованы. Это привело к тупиковой ситуации между региональным водным округом Таррант, отвечающим за проект, и городом Форт-Уэрт, его основным партнером.

Panther® Pro — США — Урожай

Гербицид

Panther® Pro объединяет в себе силу трех активных компонентов в первом жидком премиксе с флумиоксазином. Panther Pro, предназначенный для предпосадочного и предвсходового использования на соевых бобах, поддерживает чистоту полей с превосходным остаточным контролем над более чем 60 широколистными сорняками и травами.

ПОЛУЧИТЕ НАГРАДУ В ЛУЧШЕЙ ПРОГРАММЕ ПРОИЗВОДИТЕЛЬНОСТИ ПРОГРАММЫ. Узнайте здесь 3 способа поддержать успех весеннего сгорания.

---

Избавьтесь от сорняков сои с помощью Pro Power и Liquid Convenience.

Гербицид

Panther® Pro объединяет в себе силу трех активных компонентов в первом жидком премиксе с флумиоксазином. Предназначен для предпосадочного и предвсходового использования сои, Panther Pro поддерживает поля в чистоте с превосходным остаточным контролем над более чем 60 широколистными сорняками и травами, включая устойчивую к глифосату амброзию обыкновенную, коноплю обыкновенную и коноплю.Кроме того, Panther Pro можно смешивать с маркированными продуктами глифосата или глюфосината, такими как Credit® Xtreme для программ осеннего, парового и весеннего выгорания. Panther Pro также может использоваться для защиты от сорняков залежей и необсаженных земель.

ТРИ АКТИВНЫХ ИНГРЕДИЕНТА ДЛЯ ВЫСОКОГО КОНТРОЛЯ

• Первый жидкий премикс флумиоксазина — три активных ингредиента, три режима действия
• Превосходное средство борьбы с сорняками с широким спектром действия для соевых бобов
• Продолжительный остаточный контроль более чем 60 широколистных сорняков и трав, включая восприимчивые озимые однолетники и многие устойчивые к глифосату виды
• Может применяться отдельно или как часть программы осеннего, парового или весеннего выжигания.
• Также обозначен для залежных и необсаженных земель

РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ПРИМЕНЕНИЮ — ВАРИАНТЫ ВРАЩЕНИЯ
СОЯ: Panther Pro® можно вносить на соевые бобы до посадки или до появления всходов (после посадки).Предвсходовое применение Panther Pro необходимо производить в течение 3 дней после посадки и до появления всходов сои. Применение после того, как соевые бобы начали трескаться или всходили, приведет к серьезному повреждению урожая. Не применять, когда соя начала трескаться. Выберите норму Panther Pro из таблицы Panther Pro, контролируемой или подавляемой сорняками, в соответствии с ожидаемым спектром сорняков, указанным на этикетке продукта.

Panther Pro можно вносить осенью после урожая предыдущего года или весной в качестве ранней предпосевной обработки, выжигания или довсходовой обработки.

Осеннее внесение: нанесите Panther Pro для выжигания и борьбы с остаточными сорняками после уборки предыдущего урожая.

Весеннее внесение: внесите Panther Pro на ранних этапах предпосевной подготовки и до появления всходов для выгорания и борьбы с остаточными сорняками до появления всходов.

Выжигание — Предвсходовое выжигание сои, Послевсходовое выжигание сорняков: Panther Pro, применяемый как часть программы выгорания, может использоваться для остаточной борьбы с сорняками, а также для помощи в послевсходовом выжигании многих однолетних и многолетних сорняков. где соевые бобы будут высаживаться непосредственно на несвежее семенное ложе, покровную культуру или в пожнивные остатки предыдущих культур.Информацию о борьбе с появившимися сорняками с помощью Panther Pro см. В Таблице — Сорняки, контролируемые или подавляемые послевсходовой активностью Panther Pro на этикетке продукта.

Наносите Panther Pro с помощью наземного оборудования перед посадкой, во время посадки или в течение 3 дней после посадки, но до появления всходов. Чтобы обеспечить полное покрытие, используйте минимум 15 галлонов раствора для опрыскивания на акр. См. Этикетку партнера по смешиванию резервуаров для получения информации о заданном давлении применения. Все баковые смеси Panther Pro, применяемые для борьбы с появившимися сорняками, должны применяться с концентратом растительного масла или метилированным маслом семян из расчета 1-2 пинты на акр или неионогенным поверхностно-активным веществом из расчета 0.25% об. / Об.

Полную норму внесения и рекомендации см. На этикетке.

EPA REG. №: 71368-120
АКТИВНЫЙ INGR .: метрибузин (31,83%), флумиоксазин (7,11%), аммониевая соль имазетапира (6,02%)
ФОРМУЛЯЦИЯ: жидкий
CHEM. СЕМЬЯ: N-фенилфталимид, триазин, имидазолинон
НОМЕР ГРУППЫ: 5, 14 и 2
РЕЖИМ ДЕЙСТВИЯ: Ингибитор фотосистемы II, ингибитор PPO, ингибитор ALS
REI: 12 часов
СИГНАЛ: СИГНАЛ предостережение
RES.ПРИМЕНЕНИЕ: №
РАЗМЕР УПАКОВКИ: Контейнер 2,5 галлона (2 на ящик), сумка на 265 галлонов

ОСНОВНЫЕ ОБЛАСТИ ПРИМЕНЕНИЯ
Соевые бобы
Заросли
Открытые земли на неурожайных сельскохозяйственных угодьях

КЛЮЧЕВЫЕ КОНТРОЛИРУЕМЫЕ СОРНЯКИ
(Полный список см. На этикетке продукта)
Карпетвид
Звездчатка (обыкновенная, мышеловка)
Одуванчик
Эклипта
Примула вечерняя (солянка)
Кресс-салат полевой
Флоридская пустая трава
Пусли Флорида
Пусли зеленый гигантский (зеленый гигантский лисохвост) желтый)
Хенбит
Кочия
Ягненок (обычный)
Лондонская ракета
Мальва (маленькая, Венеция)
Морнингайл / конский водоросль
Морнинглори (мелкий цветок, высокий)
Пасленовые (черный, восточно-черный, мохнатый)
Сосвинки (амарант, краснокорень, гладкий ,
колючий, кувыркающийся)
Колючий салат
Колючая сида (чайная трава)
Колючая лоза
Портулак (обыкновенный)
Редис (дикий)
Амброзия (обыкновенная)
Redmaids
Пастушья кошелек
Смартвид (ladysthumb, Пенсильвания)
Колючий
Молочай пятнистый
Вельветовый
Конопля обыкновенная

Библиотека семейств и подсемейств белков, проиндексированных функцией

1. Пол Д.Thomas1,3,
2. Майкл Дж. Кэмпбелл1,
3. Аниш Кеджаривал,
4. Хуайю Ми,
5. Брайан Карлак2,
6. Робин Даверман,
7. Карен Димер,
8. Анушья Муругануджан и
9. Апурва Наречания

1. Protein Informatics, Celera Genomics, Foster City, California 94404, USA

Аннотация

В эпоху геномики одна из фундаментальных целей — охарактеризовать функцию белков в широком масштабе.Мы описываем метод PANTHER для надежной и точной связи взаимосвязей между последовательностями белков и функций. ПАНТЕРА состоит из двух основных компонентов: библиотеки PANTHER (PANTHER / LIB) и индекса PANTHER (PANTHER / X). PANTHER / LIB — это коллекция «книг», каждая из которых представляет семейство белков в виде множественного выравнивания последовательностей, скрытую марковскую модель (HMM), и генеалогическое древо. Функциональное расхождение внутри семейства представлено разделением дерева на поддеревья на основе общих функцией и поддеревом HMM.PANTHER / X — это сокращенная онтология для обобщения и навигации по молекулярным функциям и биологические процессы, связанные с семьями и подсемействами. Мы применяем PANTHER в трех областях активных исследований. Первый, мы сообщаем о размере и разнообразии последовательностей семейств и подсемейств, характеризующих взаимосвязь между последовательностями дивергенция и функциональная дивергенция в широком диапазоне семейств белков. Во-вторых, мы используем онтологию PANTHER / X, чтобы дать высокоуровневое представление функции генов в геномах человека и мыши.В-третьих, мы используем семейство HMM для ранжирования миссенс однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в масштабе всей базы данных в соответствии с их вероятностью влияния на функцию белка.

Сноски

• [Дополнительные материалы доступны в Интернете по адресу http://panther.celera.com/publications/gr7724_03=suppl.]

• Статья и публикации находятся по адресу http: // www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.772403.

• №1 Эти авторы внесли равный вклад в данную работу.

• №3 Автор, ответственный за переписку.